阿拉山口市人民检察院成立于2013年12月30日。按照最高人民检察院〔2013〕115号《关于设立阿拉山口市人民检察院的批复》正式设立阿拉山口市人民检察院，机构编制为副县级。根据中央、上级人民检察院和自治区机构改革要求和2019年11月13日博州人民检察院《关于对单位职能配置、内设机构和人员编制规定最终审核的通知》，确定阿拉山口市人民检察院主要职责14条，整合后拟重新组建内设机构3个，1个综合行政部（司法警察大队），2个检察业务部（第一检察部、第二检察部）。侦查监督科（公诉科、监所检察科、案件管理办公室）合并更名为第一检察部。民事行政检察科（控告申诉检察科）合并为第二检察部。政治处、办公室、法警队、纪检监察室合并为综合行政部（司法警察大队）。